Kitabesi Rus harbinde kırılmış olduğu için yapılış tarihi tam olarak bilinememekle birlikte mimari özelliklerinden yola çıkılarak 14. yüzyılda yapıldığı tahmin edilmektedir. Ahlat, İki Kubbe mahallesinde bulunan ve yapılan araştırmalar sonucunda inşası 1306 yılına kadar dayanan kümbet, Emir Ali adına yapılmıştır.
Kare planlı bir ana mekana sahip Emir Ali Kümbeti, tek katlıdır. Kümbetin avlusuna doğuda bulunan kapısından girilir. Türbe kısmı ise; sivri bir kemerle avluya açılır. Ahlat kümbetleri arasında değişik planı ile dikkati çeken Emir Ali Kümbeti daha çok eyvanlı kümbetleri arasında yer alıyor.
Kümbet; içten kubbe dıştan ise piramidal külahla örtülerek yapılmıştır. Kubbeye geçiş ise pandantiflerle sağlanmıştır. Bu yapının diğer kümbetlerde olduğu gibi mumyalık kısmı bulunmamaktadır.